La Gobernanza del Agua es el proceso de gestión ambiental que relaciona actividades económicas, sociales y culturales, inconexas en apariencia, pero estrechamente relacionadas con los impactos que tienen sobre los sistemas físico-bióticos y el ambiente de cada una de las cuencas que pertenecen al POMCA del río Loro, río Las Ceibas y otros directos al Magdalena.
Se espera reforzar la red de monitoreo hidrometeorológico para mejorar el manejo del agua en las diferentes temporadas climáticas del año y direccionar la problemática de la contaminación por residuos sólidos y aguas servidas de procesos agrícolas hacia un escenario de disponibilidad apropiado para la dinámica hídrica de las cuencas que pertenecen al POMCA del río Loro, río Las Ceibas y otros directos al Magdalena.
Su objetivo es promover el acceso y aprovechamiento responsable del agua a través de la interacción comunitaria, la interculturalidad y el fortalecimiento institucional hacia la gobernanza del agua. Mediante estrategias como: Caracterización de las necesidades de la población, seguimiento y control a concesiones y a caudales de fuentes hídricas, apoyo a programas de uso eficiente del agua (PUEAA), construcción e instalación de estructuras de almacenamiento de agua, apoyo en el diseño de estructuras de control y capacitación gestión integral del recurso hídrico.
Este programa busca minimizar los múltiples problemas causados por las diferentes actividades antrópicas (Prácticas agropecuarias inadecuadas que generan escorrentía y por consiguiente altos niveles de sedimentación, y contaminación de fuentes hídricas por aguas residuales de tipo doméstico y agropecuario por residuos sólidos orgánicos), con el fin de mejorar la situación de las aguas superficiales y subterráneas, que involucran tanto temas de reglamentación y administración como de saneamiento básico y manejo de residuos sólidos y líquidos, entre otros.